Определение РНК коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI (Human Coronavirus) в мазках со слизистой оболочки носа методом ПЦР

Определение РНК коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI (Human Coronavirus) в мазках со слизистой оболочки носа методом ПЦР

Описание

Коронавирусы (лат. Coronaviridae) — это семейство РНК-содержащих вирусов, включающее на май 2020 года 45 видов, объединённых в два подсемейства. Коронавирусы поражают млекопитающих (включая человека), птиц и земноводных. Название связано со строением вируса, шиповидные отростки которого напоминают солнечную корону. Известно 7 коронавирусов, поражающих человека:

  • HCoV-229E — альфа коронавирус, впервые выявлен в середине 1960-х годов;

  • HCoV-NL63 — альфа коронавирус, возбудитель был выявлен в Нидерландах в 2004 году;

  • HCoV-OC43 — бета коронавирус A, возбудитель выявлен в 1967 году;

  • HCoV-HKU1 — бета коронавирус A, возбудитель обнаружен в Гонконге в 2005 году;

  • SARS-CoV — бета коронавирус B, возбудитель тяжёлого острого респираторного синдрома, первый случай заболевания которым был зарегистрирован в 2002 году;

  • MERS-CoV — бета коронавирус C, возбудитель ближневосточного респираторного синдрома, вспышка которого произошла в 2015 году;

  • SARS-CoV-2 — бета коронавирус B, выявлен во второй половине 2019 года, вызвал пандемию COVID-19, следствием которой стало закрытие границ и введение экстренных мер безопасности (карантин, строгая изоляция, ношение масок и так далее).

Данное исследование включает определение РНК коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI (Human Coronavirus). 

HCoV-229E — вид вирусов из семейства коронавирусов, который поражает людей и летучих мышей. Инфекция может протекать как в форме простуды, так и в тяжёлых формах заболевания, включая пневмонию и бронхиолит. Наиболее часто обнаруживается вместе с другими респираторными вирусами, особенно с респираторно-синцитиальным вирусом человека (HRSV).

HCoV-OC43 является одним из известных вирусов, которые вызывают простуду. Вирус может вызвать серьезные инфекции нижних дыхательных путей, в том числе пневмонии у детей раннего возраста, пожилых людей и ослабленных лиц.

HCoV-NL63 является важной причиной тяжелых инфекций нижних дыхательных путей у взрослых и детей.

HCoV-HKU1 был выделен у взрослых с пневмонией. ОРВИ вызывает атипичную пневмонию, которая несет 10% летальности.

Источниками коронавирусных инфекций могут быть больной человек и  животные. Возможные механизмы передачи: воздушно-капельный, воздушно-пылевой, фекально-оральный, контактный. Заболеваемость растёт зимой и ранней весной. В структуре ОРВИ госпитализированных больных коронавирусная инфекция составляет в среднем 12 %. О широкой распространённости коронавирусов свидетельствуют специфичные антитела, выявленные у 80 % людей.

Анализ на ПЦР исследование направлен на выявление РНК (генетического материала) возбудителя.


  • Тип биоматериала:

    МАЗОК

  • Тип пробирки, цвет крышки:

    Эппендорф с транспортной средой

Подготовка
  • Взятие материала желательно проводить до диагностических и лечебных манипуляций в предполагаемом месте локализации возбудителя. 

  • Взятие биологического материала рекомендуется проводить до начала применения лекарственных препаратов (антибактериальных, противовирусных, противопаразитарных). 

  • При проведении исследований в целях контроля лечения целесообразно проводить взятие проб на ПЦР-тесты не ранее, чем через 10-14 дней после окончания применения соответствующих препаратов локального действия и не ранее, чем через 1 месяц после проведения системной терапии. 

  • Материал для исследования можно взять утром натощак или в течение дня, не ранее чем через 2 часа после еды. Чистить зубы и пить воду можно.

  • За 6 часов до исследования не рекомендуется использовать лекарственные средства для орошения ротоглотки и препараты для рассасывания.

  • Перед началом исследования прополоскать полость рта водой комнатной температуры.

Что означают результаты теста

При отсутствии РНК коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI (Human Coronavirus) в мазках со слиз. обол. носа выдается результат «отрицательно/не обнаружено». 

В случае обнаружения РНК коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI (Human Coronavirus) в мазках со слиз. обол. носа выдается результат «положительно/обнаружено».

Положительный результат анализа на определение РНК коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI (Human Coronavirus) в мазках со слиз. обол. носа методом ПЦР:

  • В анализируемом образце биологического материала найдены фрагменты РНК, специфичные для коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI.

Отрицательный результат анализа на определение определение РНК коронавирусов 229E, OC43, NL63, HKUI (Human Coronavirus) в мазках со слиз. обол. носа методом ПЦР:

  • В анализируемом образце биологического материала не найдено фрагментов РНК, специфичных для 229E, OC43, NL63, HKUI, или концентрация возбудителя в образце ниже границы чувствительности метода.